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Proposition de stage (master 2) : Evolution de la spécificité en environnement hétérogène

Je diffuse une proposition de stage (financé par ANR blanche, poursuite en thèse possible) pour un Master 2 (évolution, biologie évolutive, …), qui commence en janvier prochain (2010). Le stage sera effectué à l’Institut des Sciences de l’Evolution de l’université Montpellier 2, et encadré par mon boss et moi-même. Vous pouvez me contacter pour plus […]

Je diffuse une proposition de stage (financé par ANR blanche, poursuite en thèse possible) pour un Master 2 (évolution, biologie évolutive, …), qui commence en janvier prochain (2010). Le stage sera effectué à l’Institut des Sciences de l’Evolution de l’université Montpellier 2, et encadré par mon boss et moi-même. Vous pouvez me contacter pour plus d’informations.

Description du sujet

La question de la réponse au stress est centrale en sciences biologiques, et a reçu une attention très importante en écologie et biologie évolutive ces dernières années. Quelle est la réponse évolutive des organismes à un stress environnemental? Comment cette réponse est-elle contrainte par, et affecte t-elle les relations fortes (notamment de coévolution antagoniste [1]) avec d’autres espèces? Les systèmes microbiens représentent un moyen intéressant d’explorer ces questions générales [2].

Des prédictions théoriques [3] proposent que les parasites se spécialisent sur des ressources dont la pérennité dans le temps évolutif est assurée (predictible resources). Le stress représenté par une variation environnementale est susceptible de modifier les chances de survie des hôtes, affectant ainsi les possibilités de spécialisation des parasites. En parallèle, plusieurs auteurs ont proposé que l’alternance entre différents environnement permettait la coexistence de stratégies spécialistes et généralistes [4, 5].

L’objectif de ce stage est, en utilisant des populations déjà différenciées d’un couple modèle en évolution expérimentale (Pseudomonas fluorescens et son phage lytique SBW25 Phi-2 [6]) ayant co-évolué dans des environnements différents (forte et faible salinité, en alternance), de mesurer l’évolution de la spécificité des phages pour leurs différents hôtes. Les populations ont été obtenues en propageant, pendant 12 transferts (approx. 100 générations) des populations de bactéries exposées ou non au phage, en alternant entre les environnements hyper-salins et normaux.

Ce stage permettra de tester les attendus théoriques sur l’évolution de la spécificité dans un environnement hétérogène. Il sera effectué dans l’équipe «Ecologie, évolution, communautés» de l’Institut des Sciences de l’Evolution.

Bibliographie :

  1. Thompson, J.N., The Geographic Mosaic of Coevolution. 2005: University Of Chicago Press.

  2. Jessup, C.M., et al., Big questions, small worlds: microbial model systems in ecology. Trends in Ecology \& Evolution, 2004. 19(4): p. 189–197.

  3. Ward, S., Assessing Functional Explanations of Host-Specificity. American Naturalist, 1992. 139(4): p. 883.

  4. Kassen, R., The experimental evolution of specialists, generalists, and the maintenance of diversity. Journal of Evolutionary Biology, 2002. 15(2): p. 173–190.

  5. Jasmin, J.-N. and R. Kassen, On the experimental evolution of specialization and diversity in heterogeneous environments. Ecology Letters, 2007. 10(4): p. 272–281.

  6. Buckling, A. and P.B. Rainey, Antagonistic coevolution between a bacterium and a bacteriophage. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2002. 269(1494): p. 931–936.

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Timothée