Archives du mot-clef Génomique

Sur les traces de la réponse immunitaire d’une momie inca vieille de 500 ans.

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En 1999, une équipe d’archéologues découvre les tombes de trois enfants enterrés à 25 m du sommet du Llullaillaco, un volcan situé à la frontière de l’Argentine et du Chili. Des tombes sont extraits une jeune fille de 15 ans, baptisée « La Doncella » (la jeune fille), un enfant de 7 ans (El Niño) et une [...]
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Grandeur et chute de la bioinformatique ? Promesses et progrès

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bioinfo
De manière exceptionnelle, ce billet va consister pour l’essentiel en la traduction d’un article paru dans une revue spécialisée. Il s’agit d’un article d’opinion, écrit par Christos Ouzounis, bioinformaticien grec, qui décrit de manière que je trouve intéressante l’histoire de la bioinformatique, discipline jeune, et de ses relations avec le reste de la biologie. J’ai [...]
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Annoter un gène, un génome, c’est quoi ?

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mistranslations
En réponse aux questions obtuses de JRobinss (ex Julien) sur le billet « conjecture orthologue« , je vais expliquer le mot annotation en contexte de bioinformatique / génomique, et au passage montrer que dans la biologie moderne, les expériences fournissent des données incompréhensibles et inutiles à moins que de bons et nobles bioinformaticiens ne leur donnent du sens. [...]
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Chromosome Y: grandeur et décadence

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Si il est bien une paire de chromosomes humains que le grand public connait bien, il s’agit des chromosomes X et Y, encore appelés chromosomes sexuels. Les scientifiques s’y intéressent également de très près notamment car, chez les humains et la majorité des mammifères, cette paire de chromosomes définit le sexe d’un individu (les femelles [...]
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Chromosome Y: grandeur et décadence

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xandy-150x150
Si il est bien une paire de chromosomes humains que le grand public connait bien, il s’agit des chromosomes X et Y, encore appelés chromosomes sexuels. Les scientifiques s’y intéressent également de très près notamment car, chez les humains et la majorité des mammifères, cette paire de chromosomes définit le sexe d’un individu (les femelles [...]
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Histoire d’un article : la solution de la conjecture orthologue

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log
Aujourd’hui un billet un peu particulier. Nous avons publié récemment un papier sur la fonction de gènes orthologues et paralogues (voir aussi ce billet), et mon co-auteur Christophe Dessimoz a écrit un billet invité sur le blog de Jonathan Eisen, qui donne « l’histoire derrière le papier ». Je vais vous proposer ici une traduction de son [...]
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L’amphioxus, un génome fossile vivant ?

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ancestor
Je vais parler d’un petit article de revue que nous avons publié récemment avec des collègues, sur l’amphioxus. Les amphioxus sont des chordés, comme nous, mais contrairement à nous pas des vertébrés (voir ce billet de Tom Roud). Ils sont notamment intéressants à étudier parce qu’ils resemblent morphologiquement aux fossiles les plus anciens d’ancêtres de [...]
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La variation debout, ou d’où viennent les mutations en évolution ?

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renards
Une question qui revient parfois quand je discute science avec non biologistes, c’est l’origine de la variabilité génétique qui permet l’évolution. En fait, la question est rarement posée comme ça, c’est plutôt moi qui cause là. La question de base c’est : les mutations apparaissent-elles parce qu’il y a en besoin, ou sont-elles déjà là [...]
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Séquençage de l’ADN: la révolution est (de nouveau) en marche

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Séquencer l’ADN. Voilà une idée qui a longtemps relevé de la science fiction et nourri bien des fantasmes au sein de la communauté scientifique. Et pour cause. Si la structure de l’ADN, support de notre information génétique, a été découverte en 1953, il aura fallu attendre la seconde moitié des années 70 pour que Frederick [...]
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Séquençage de l’ADN: la révolution est (de nouveau) en marche

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Séquenceur Ion Proton à Davos
Séquencer l’ADN. Voilà une idée qui a longtemps relevé de la science fiction et nourri bien des fantasmes au sein de la communauté scientifique. Et pour cause. Si la structure de l’ADN, support de notre information génétique, a été découverte en 1953, il aura fallu attendre la seconde moitié des années 70 pour que Frederick [...]
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