La saga des cellules souches continue à nous éclairer sur le fonctionnement de la science (à défaut de celui des cellules)

Bon alors l’histoire des cellules souches magiques, ça ne s’améliore pas (1ère partie, 2ème partie). Un des auteurs, Teru Wakayama, appelle l’article à être retiré, la 1ère auteure (Haruko Obokata, qui a fait les manips) demande à ce que sa thèse soit rétractée, que du bon. Et l’institut où les manips ont été en grande partie […]
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Rififi chez les bioinformaticiens : peut-on tout critiquer sur tous les tons ?

Un billet forcément trop court pour rendre compte d’un débat important et très animé qui a eu lieu ces deux dernières semaines, sur le blog de Lior Pachter, le même qui avait déclenché le débat sur les méthodes utilisées en bioinformatiques en fin d’année dernière. Dans une série de trois billets (The network nonsense of […]
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Cellules souches à l’acide : mauvais trip ?

Un billet rapide pour rebondir sur le commentaire de Stephane sur mon billet précédent sur les cellules souches obtenues par traitement à l’acide : il semble d’une part qu’il y ait des doutes sur certaines figures des articles, et d’autre part un effort collectif pour reproduire les résultats n’a pas (encore ?) abouti (blog ipscell). […]
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L’évolution est-elle une science ?

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Nous avons posé ces questions que plus personne n’ose poser. Pourquoi ce domaine – plus que d’autres – est-il sujet à des attaques permanentes et à des récupérations de toutes sortes? Et d’abord, qu’est-ce que l’évolution? Est-une science? Discussion de haute tenue avec Pierre Kerner - chercheur en génétique évolutive, maître de conférences en biologie des organismes à […]
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Les méthodes bioinformatiques utilisées en génomique sont importantes #methodsmatter #BigScience

A l’occasion du projet ENCODE, j’ai déjà évoqué les avantages et inconvénients de la Big Science en biologie (billet ENCODE, billets sur critiques d’ENCODE 1 et 2, billet Big Science). Il y a en ce moment un débat très animé sur blogs et Twitter, concernant une question importante sur ces gros projets : les méthodes […]
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Notes sur ma semaine en sciences 4

Un bilan de 451 additifs alimentaires autorisés aux Etats-Unis entre 1997 et 2012 indique que l’expertise n’a jamais été indépendente, et qu’elle a été faite par un employé de la compagnie concernée dans 22% des cas. Clairement, un système à revoir. Article d’accès libre. J’ai commencé à écrire ma prochaine demande de financement au Fonds [...]
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Impact du maïs #OGM Bt sur l’environnement

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Dans une discussion récente avec un collègue écologiste aux deux sens du terme, il m’a dit qu’il restait inquiet sur l’impact des OGM sur l’environnement. Mais il n’avait pas de références précises à me fournir. Entre temps j’ai trouvé un article que je ne connaissait pas mais qui apparemment été très débattu, que nous allons [...]
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ADN de Big Foot : comment être critique de la pseudo-science sans être méprisant ?

J’ai été contacté récemment pour donner mon avis sur le séquençage d’ADN de Big Foot (ou Sasquatch), le « yéti » nord américain. A l’époque où ce « résultat » avait été « publié » je n’avais pas réagi, vu qu’il était suffisamment couvert à mon avis par taupo sur le blog Strange Stuff and Funky Things. Les guillemets un peu [...]
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La grosse expérience, la carte et l’aventure, trois types de « Big Science »

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Deuxième billet sur le commentaire de Sean Eddy sur ENCODE et sur les réactions à ENCODE. Le premier était sur le projet génome aléatoire. Ce deuxième billet est sur une classification que Sean propose des projets de « Big Science », ces gros projets scientifiques qui mobilisent de nombreuses équipes et de nombreux chercheurs et coûtent très [...]
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Le génome aléatoire, un contrôle pour interpréter 15 To de données sur le génome humain

Il y a un nouveau papier de commentaire sur ENCODE qui est sorti, qui est court mais contient plusieurs points intéressants, donc je vais le discuter dans deux billets, dont ceci est le premier. Comme discuté précédemment (voir ici et ici), ENCODE est un énorme consortium d’expériences pour déterminer l’activité et la fonction du génome [...]
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